Panu Sivonen aloitti opiskelut Jyväskylän yliopiston musiikkitieteen laitoksella vuonna 1994. Vuonna 1996 hän aloitti opinnot myäs Keski-Suomen konservatorion pedagogilinjalla tärkeimpinä opettajinaan oboessa Tauno Hämäläinen, oboepedagogiikassa Sirpa Berg, nokkahuilussa Christine Bürklin ja kamarimusiikissa Merja Soisaari. Varsin pian yliopisto jäi sivuosaan ja Sivonen valmistui konservatoriosta oboepedagogiksi 1999. Hän jatkoi opintojaan Sibelius-Akatemian esittävän säveltaiteen osastolla Jouko Teikarin johdolla. Musiikin maisteriksi hän valmistui Sibelius-Akatemiasta vuonna 2006.
Jyväskylän-vuosinaan Sivonen soitti lukuisissa yhtyeissä ja orkestereissa, joista tärkeimpinä hän pitää laulelmayhtye Kentauria ja lähes pahamaineista improvisaatioyhtye Peräkammäria, joille molemmille hän on myös säveltänyt musiikkia. Peräkammärin riveissä alkoi hänen ja Kimmo Kuokkalan ystävyys ja yhteistyö.
Sivonen on toiminut Vaasan kaupunginorkesterin oboistina vuodesta 2005. Hän on myös jatkanut yliopisto-opintojaan Jyväskylässä suorittaen hum.kand. tutkinnon vuonna 2006.